Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms