Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP68Q9UHB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms