Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT8Q9UFF9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms