Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKX1-2Q9UD57 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms