Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPAQ9P0L0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAPAQ9P0L0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms