Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSRB1Q9NZV6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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