Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms