Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR7Q9NYK1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR7Q9NYK1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms