Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX43Q9NXZ2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms