Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3EQ9NVU0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms