Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC6A13Q9NSD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms