Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER2Q9NSB8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms