Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms