Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCND1Q9NSA2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms