Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms