Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD2Q9NRG4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms