Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LGR6Q9HBX8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGR6Q9HBX8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGR6Q9HBX8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGR6Q9HBX8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGR6Q9HBX8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.58■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LGR6Q9HBX8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LGR6Q9HBX8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms