Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LY9Q9HBG7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms