Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF2Q9HAU5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms