Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK3Q9H422 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK3Q9H422 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms