Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00597Q9H2U6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms