Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIOBPQ9H2D6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOBPQ9H2D6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOBPQ9H2D6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms