Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHACTR1Q9C0D0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms