Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTNAP4Q9C0A0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP4Q9C0A0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms