Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXQ1Q9C009 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXQ1Q9C009 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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