Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM31Q9BZY9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM31Q9BZY9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms