Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM54Q9BYV2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM54Q9BYV2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM54Q9BYV2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM54Q9BYV2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM54Q9BYV2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM54Q9BYV2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM54Q9BYV2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM54Q9BYV2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms