Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms