Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms