Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms