Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY3Q9BT09 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms