Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT17Q9BSW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT17Q9BSW7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms