Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms