Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms