Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC77Q9BR77 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms