Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms