Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPGQ9BPX3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPGQ9BPX3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms