Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRG3Q99928 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GABRG3Q99928 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms