Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LGMNQ99538 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms