Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC5LQ99459 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC5LQ99459 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC5LQ99459 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms