Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYCBPQ99417 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms