Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK5RAP2Q96SN8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP2Q96SN8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms