Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC138Q96M89 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC138Q96M89 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC138Q96M89 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC138Q96M89 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC138Q96M89 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC138Q96M89 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC138Q96M89 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms