Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNBD2Q96M20 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms