Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP170P1Q96L14 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP170P1Q96L14 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms