Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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