Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP36Q96G28 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms