Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM11Q96F44 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM11Q96F44 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms