Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms