Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMD3Q96D46 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms